Fungicidi so razvrščeni glede na način uporabe

1. Zaščitno sredstvo
Preden patogeni mikroorganizmi pridejo v stik z rastlino ali potopijo rastlino, rastlino ali okolico obdelamo z zdravilom, da zaviramo kalitev patogenih spor ali uničimo vzklile patogene spore, da zaščitimo rastlino pred poškodbami. Ta učinek se imenuje zaščitni učinek. Sredstva s tem učinkom so zaščitna sredstva. Kot so mešanica Bordeaux, cink cink, bakrov sulfat, zeleni mlečni baker, mankozeb, klorotalonil in tako naprej.
2. Terapevtska sredstva
Patogeni mikroorganizmi zdravilnega sredstva so se infiltrirali v rastlino, vendar rastlina kaže simptome in je v inkubacijski dobi. Zdravilo prodre v rastlinsko tkivo iz povrhnjice rastline in s transdukcijo, difuzijo ali proizvodnjo metabolitov uniči ali zavre povzročitelja bolezni, tako da obolela rastlina ne bo več trpela in bo povrnila zdravje. Učinkovine, ki imajo ta terapevtski učinek, imenujemo terapevtiki ali kemoterapevtiki. Kot so tiofanat-metil, karbendazim, kasugamicin in tako naprej.
3. Sredstvo za izkoreninjenje
Eradikanti se nanašajo na patogene, ki lahko neposredno uničijo patogene, ki so napadli rastline, ko se uporabljajo po tem, ko so rastline okužene. Sredstva s takšnim izkoreninjevalnim učinkom so sredstva za izkoreninjenje. Kot so tiram, natrijev pentaklorofenat, žveplovo apno in tako naprej.